2148年　迫り来る宇宙からの脅威「フェストゥム」より人類を守り、奪われた皆城総士を救出し、
人類に味方するフェストゥムのコアを解放する為の作戦「蒼穹作戦」より2年･･･
平和は守られたはずだった。
総士は存在が消滅しながらも、いつか竜宮島へ戻ると一騎と約束をした。
少年少女たちは取り戻した平和の中、日々を生きていた。
そんなある日、一隻の艦が竜宮島へ打ち揚げられる。
中には1人の少年が眠っていた。
そして、突如平和は破られる･･･。